皇家金堡

马磊导师简介
 
发布人:皇家金堡  发布时间:2015-04-01   浏览次数:3561

 

 


马磊,男,19796月出生,博士,副教授,现从事生物信息学与遗传资源方面的研究。

  

1. 学习和工作经历

2005年至今,皇家金堡,讲师、副教授;

2013年-2014年,新西兰奥塔哥大学,访问学者(博士后);

2011年-2014年,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,博士后;

2007年-2010年,西北农林科技大学,生物信息学专业,博士学位;

2002年-2005年,西北农林科技大学,动物遗传育种与繁殖专业,硕士学位。

  

2. 招生资格、入选人才计划及开设课程

2014年获硕士导师招生资格,入选石河子大学青年骨干教师培养计划、青年教师与对口支援高校名师结对子培养计划。

先后承担本科生《遗传学》、《生物统计学》、《生物信息学》、《PERL编程技术》、研究生《生物信息学算法导论》、《分子进化与系统发育》等课程。

  

3. 主要研究方向

生物信息学方向:利用数学、统计学和信息科学的方法,探索基因组进化、基因表达调控、基因互作网络等方面的理论和算法。

遗传资源方向:应用生物信息学技术,搜寻、分析和可视化特殊生境中抗旱、抗冻、耐盐碱、固沙等方面的分子遗传特质和生态效应。

  

4. 承担的科研项目

国家自然科学基金:应用CPR改进基因共表达网络探究反式剪接的调控因子及机制,编号:318603082019/01 - 2022/12,在研,主持。

国家自然科学基金:应用基因共表达网络探究羽毛针禾的荒漠适应性分子机制,编号:317603022018/01 - 2021/12,在研,主要成员。

国家自然科学基金:基于GBS-RNA-seq整合组学解析羽毛针禾基因组变异与沙生适应性的关系,编号:315603102016/01-2019/12,在研,主持。

国家自然科学基金:基于猪生殖系统研究嵌合RNA的形成新机制及其繁殖调控功能,2013/01 - 2016/12,编号:31272416,结题,主持。

国家高技术研究发展计划(863)子课题:猪经济性状的功能基因组学研究,编号:2013AA1025022013/01 - 2017/12,结题,主持。

人力资源和社会保障部留学人员科技活动择优资助项目(启动类):基于GBS-SNPs技术研究固沙植物羽毛针禾基因流动态及沙生适应性,编号:2015LX0042016/01 - 2018/06,结题,主持

中国博士后科学基金特别资助:结合五指山猪基因组探讨嵌合RNA的形成新机制及其功能,编号:2012T501662013/01 - 2014/12,结题,主持

中国博士后科学基金面上一等资助:基于高通量组学数据研究猪microRNA靶向调控网络及功能,编号:201104900452012/01 - 2014/12,结题,主持

石河子大学高层次人才科研启动专项(博士类):绵羊融合RNA与其亲本基因的鉴定、功能及在毛囊组织中的表达规律研究,编号:RCZX2011372012/01 - 2014/12,结题,主持

石河子大学高层次人才科研启动专项(硕士类):家禽细胞趋化因子MCP-1克隆及表达研究,编号:RCZX2005232006/01 - 2007/12,结题,主持

  

5. 代表性科研成果

主要论文:

Kai Wei, Lei Ma*, Tingting Zhang*. Characterization of Gene Promoters in Pig: Conservative Elements, Regulatory Motifs and Evolutionary Trend. PeerJ 2019, 7: e7204.

Tingting Zhang, Feng Hu, Lei Ma*. Phosphate-Solubilizing Bacteria from Safflower Rhizosphere and Their Effect on Seedling Growth. Open Life Sciences 2019, 14(1): 246-254.

Kai Wei#, Tingting Zhang#, Lei Ma*. Divergent and convergent evolution of housekeeping genes in human-pig lineage. PeerJ 2018, 6:e4840.

Lei Ma, Shulin Yang, Weiming Zhao, Zhonglin Tang, Tingting Zhang, Kui Li*. Identification and analysis of pig chimeric mRNAs using RNA sequencing data. BMC Genomics 2012, 13(1):429.

Lei Ma, Tingting Zhang, Zhuoran Huang, Xiaoqian Jiang, Shiheng Tao*. Patterns of nucleotides that flank substitutions in human orthologous genes. BMC Genomics 2010, 11(1):416.

Weimin Zhao, Yulian Mu, Lei Ma, Chen Wang, Zhonglin Tang, Shulin Yang, Rong Zhou, Xiaoju Hu, Menghua Li, Kui Li*. Systematic identification and characterization of long intergenic non-coding RNAs in fetal porcine skeletal muscle development. Scientific Reports 2015, 5: 8957-8957.

Miaoying Yu, Yinghui Wei, Kui Xu, Shasha Liu,Lei Ma, Yangli Pei, Yanqing Hu, Zhiguo Liu, Xue Zhang, Bingyuan Wang, Yulian Mu, Kui Li*. EGFR Deficiency Leads to Impaired Self-Renewal and Pluripotency of Mouse Embryonic Stem Cells. PeerJ 2019, 7: e6314.

Wenlong Shen, Dong Wang, Bingyu Ye, Minglei Shi, Lei Ma, Yan Zhang* and Zhihu Zhao*. GC3-biased gene domains in mammalian genomes. Bioinformatics, 2015, 31(19): 3081-3084.

李迎侠, 张婷婷*, 马磊*. 天然嵌合基因的结构特性及其对基因设计的启示. 遗传, 2018, 40(2): 135-144.

马磊, 张婷婷*. 应用嵌合基因实例拓展遗传学染色体畸变的教学. 遗传, 2018, 40(12): 1129–35.

魏凯, 马磊*. 高通量测序时代下持家基因定义的发展. 遗传,2017, 39(2):127-134.

魏凯, 张婷婷*, 马磊*. 猪基因共表达网络模块的构建及功能分析. 畜牧兽医学报, 2017, 48 (11): 2205–15.

  

专著:

马磊,张婷婷(著),《嵌合基因——生物分子网络的桥梁》,九州出版社,北京,2016

软件著作权:

马磊,张婷婷. GBS-RNA-seq 整合组学分析软件,2017,计算机软件著作权,中国,登记号:2017SR351033.

马磊,张婷婷. Chimeric Gene转录丰度量化软件,2016,计算机软件著作权,中国,登记号:2016SR154264.

马磊,张婷婷. 嵌合基因网络效应解析软件, 2016,计算机软件著作权,中国,登记号:2016SR378638.

张婷婷,马磊. 嵌合基因结构域解析软件,2016,计算机软件著作权,中国,登记号:2016SR379095.

马磊,张婷婷. Chimeric RNA 鉴定软件,2014,计算机软件著作权,中国,登记号:2014SR216881.

  

6. 获奖情况

农业部2015年度中华农业科技奖优秀创新团队类成果奖

中国农业科学院2012年度优秀博士后奖

全国大学生生命科学竞赛二等奖、三等奖和优胜奖指导教师

石河子大学2018优秀青年教师

石河子大学2017实践教学先进个人

石河子大学2015年度优秀教案设计奖

石河子大学2016年度教学成果二等奖

石河子大学2010年度教学成果三等奖

  

7. 毕业的研究生

目前指导4名硕士生毕业,其中2名现在德国攻读博士学位,2名在国内就业;协助指导的1名博士生,现在国内高校任教。

  

8. 联系方式

电子邮箱:malei1979@hotmail.com;电话:18997888308